МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ПАТОГЕНОВ СЕРОЙ ГНИЛИ НА КЛУБНИКЕ АЛМАТИНСКОЙ ОБЛАСТИ
Основное содержимое статьи
A.Zh. Zhaxylykov
S.Seifullin Kazakh Agrotechnical Research University, Astana, Kazakhstan.
alikhanzhaxylykov33@gmail.com
A.B Ismagulova
S.Seifullin Kazakh Agrotechnical Research University, Astana, Kazakhstan
altynai14.02@mail.ruАннотация
В данной статье рассматривается выделение и идентификация 8 изолятов возбудителей серой гнили клубники из четырех сортов в Алматинской области: Vivara, Murano, Serofline и Albion. Исследованы морфо-культуральные особенности выделенных штаммов Botrytis cinerea, определена скорость радиального роста колоний в различных питательных средах. Процент идентичности восьми изолятов гриба Botrytis cinerea варьировал от 95.4% до 100%. Для большинства процент идентичности превышал 99%, что указывает на высокую степень генетической консервативности ITS-регионов. Исключение составил изолят K12 (PI = 95.4%), демонстрирующий незначительные нуклеотидные вариации, которые, однако, не повлияли на таксономическую классификацию. Выделенные штаммы были депонированы в базе данных GenBank, поддерживаемой Национальным центром биотехнологической информации (NCBI): Botrytis cinerea K1 -PV226173.1, Botrytis cinerea K2- PV226178.1, Botrytis cinerea K9- PV203239.1, Botrytis cinerea K12- PV203241.1, Botrytis cinerea K13-PV203240.1, Botrytis cinerea K24- PV203243.1, Botrytis cinerea K27- PV203242.1, Botrytis cinerea K28- PV203244.1. Построенное филогенетическое дерево показывает, что Botrytis cinerea образует большой монофилетический кластер с высокой внутривидовой изменчивостью, что подтверждает его широкое распространение. Другие виды Botrytis образуют полифилетические и стабильные группы, что отражает их таксономическую обособленность.
Информация о статье
##plugins.generic.dates.accepted## 2025-03-28
##plugins.generic.dates.published## 2025-03-31
Библиографические ссылки
Ismagulova A., Spanbayev A., Tulegenova Zh., Eken C. First Report of Preharvest Fruit Rot of Strawberry Caused by Botrytis cinerea in Kazakhstan // Plant Disease – 2020. – Vol. 105(1). – P. 70. https://doi.org/10.1094/PDIS-03-20-0525-PDN
Ismagulova A.B., Tulegenova Zh., Spanbaev A.D. Research on Botrytis cinerea-caused gray rot disease in strawberries with Carpathian genus bees and entomovector technology // Bulletin of Karaganda University. Series "Biology. Medicine. Geography." – 2024. – Vol.2. – P. 29-41. https://doi.org/10.31489/2024bmg2/29-41
Minaeva L.P., Evsjukova A.D., Koltsov V.A., Zhidekhina T.V., Sedova I.B., Chalyy Z.A., Efimochkina N.R., Sheveleva S.A. Contamination of Fresh Berries and Fruits with Mycotoxins Sold on the Consumer Market of the Central Region of Russia // Health Risk Analysis. – 2022. – P. 87-99. https://doi.org/10.21668/health.risk/2022.4.08.eng
Lugauskas A., Stakeniene J. Toxin producing micromycetes on fruit, berries, and vegetables // Ann. Agric. Environ. Med. – 2002. – Vol. 9(2). – P. 83–97.
Wakiewicz A., Irzykowska L., Bocianowski J. At al. Fusariotoxins in asparagus – their biosynthesis and migration // Food Addit. Contam. Part A Chem. Anal. Control. Expo. Risk Assess. – 2013. – Vol. 30(7). – P. 1332–8. https://doi.org/10.1080/19440049.2013.796095
Kiseleva M.G., Chalyy Z.A., Sedova I.B., Minaeva L.P., Sheveleva S.A. Studying the contamination of tea and herbal infusions with myсotoxins (Message 2) // Health Risk Analysis. – 2020. – Vol. 1. – P. 38–51. https://doi.org/10.21668/health.risk/2020.1.04.eng
Fernández-Cruz M.L., Mansilla M.L., Tadeo J.L. Mycotoxins in fruits and their processed products: Analysis, occur-rence and health implications // J. Adv. Res.-2010. – Vol. 1(2). – P. 113–122. https://doi.org/10.1016/j.jare.2010.03.002
Alshannaq A., Yu J.-H. Occurrence, toxicity, and analysis of major mycotoxins in food // Int. J. Environ. Res. Public Health. – 2017. – Vol. 14(6). – P. 632. https://doi.org/10.3390/ijerph14060632
Eskola M., Kos G., Elliott C.T., Hajslova J., Mayar S., Krska R. Worldwide contamination of food-crops with myco-toxins: Validity of the widely cited ‘FAO estimate’ of 25 % // Critical Reviews in Food Science and Nutrition. – 2020. – Vol. 60(16). – P. 2773–2789. https://doi.org/10.1080/10408398.2019.1658570
Juan C., Chamari K., Manes J. Evaluation of Alternaria mycotoxins: quantification and storage condition // Food Additives and Contaminants: Part A. – 2016. – Vol. 35. – P. 861–868. https://doi.org/10.1080/19440049.2016.1177375
Rychlik M., Lepper H., Weidner C., Asam S. Risk evaluation of the Alternaria mycotoxin tenuazonic acid in foods for adults and infants and subsequent risk management // Food Control. – 2016. – Vol. 68. – P.81–185. https://doi.org/10.1016/j.foodcont.2016.03.035
Solfrizzo M. Recent advances on Alternaria mycotoxins // Current Opinion in Food Science. – 2017. – Vol. 17. – P. 57–61. https://doi.org/10.1016/j.cofs.2017.09.012
Walker, A.S., Gladieux, P., Decognet, V., Fermaud, M., Confais, J., Roudet, J., Bardin, M., Bout, A., Nicot, P. C., Poncet, C., Fournier, E. Population structure and temporal maintenance of the multihost fungal pathogen Botrytis cinerea: causes and implications for disease management // Environmental microbiology. – 2015. – Vol. 17(4). – P. 1261–1274. https://doi.org/10.1111/1462-2920.12563.
Andersen B., Thrane U. Foodborne fungi in fruit and cereals and their production of mycotoxins // Advances in Food Mycology. – 2006. – Vol. 571. – P. 137–152. https://doi.org/10.1007/0-387-28391-9_8
Microbial Food Safety. In: O.A. Oyarzabal, S. Backert eds. New York, Springer. – 2012. – P. 262. https://doi.org/10.1007/978-1-4614-1177-2
Vybornova M.V., Polunina T.S., Lavrinova V.A. Micobiota of currant berries // Nauchnye trudy Severo-Kavkazskogo Federal'nogo nauchnogo tsentra sadovodstva, vinogradarstva, vinodeliya. – 2020. – Vol. 29. – P. 122–126. https://doi.org/10.30679/2587-9847-2020-29-122-126
Enikova R.K., Stoynovska M.R., Karcheva M.D. Mycotoxins in Fruits and Vegetables // J. of IMAB. – 2020. – Vol. 26(2). – P. 3139–3143. https://doi.org/10.5272/jimab.2020262.3139
Gonçalves B.L., Coppa C.F.S.C., de Neeff D.V., Corassin C.H., Fernandes Oliveira C.A. Mycotoxins in fruits and fruit-based products: occurrence and methods for decontamination // Toxin Reviews. – 2013. – Vol. 38(4). – P. 263–272. https://doi.org/10.1080/15569543.2018.1457056
Tournas V.H., Katsoudas E. Mould and yeast flora in fresh berries, grapes and citrus fruits // International Journal of Food Microbiology. – 2005. – Vol. 105. – P. 11–17. https://doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2005.05.002
Meena M., Gupta S.K., Swapnil P., Zehra A., Dubey M.K., Upadhyay R.S. Alternaria toxins: potential virulence factors and genes related to pathogenesis // Front. Microbiol. – 2017. – Vol. 8. – P. 1451. https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.01451
Fekete E., Fekete E., Irinyi L., Karaffa L. Genetic diversity of a Botrytis cinerea cryptic species complex in Hungary // Microbiol. – Vol. 167. – P. 283-291. https://doi.org/10.1016/j.micres.2011.10.006
Gruber-Dorninger C., Novak B., Nagl V., Berthiller F. Emerging Mycotoxins: Beyond Traditionally Determined Food Contaminants // J. Agric. Food Chem. – 2017. – Vol. 65(33). – P. 7052–7070. https://DOI:10.1021/acs.jafc.6b03413
Fraeyman S., Croubels S., Devreese M., Antonissen G. Emerging Fusarium and Alternaria Mycotoxins: Occurrence, Toxicity and Toxicokinetics // Toxins. – 2017. – Vol. 9(7). – P. 228. https://DOI:10.3390/toxins9070228
Medina A., Rodríguez A., Magan N. Climate change and mycotoxigenic fungi: impacts on mycotoxin production // Current Opinion in Food Science. – 2015. – Vol. 5. – P. 99–104. https://DOI:10.1016/j.cofs.2015.11.002
Panimboza Yanzapanta, J. G. Patogenicidad y susceptibilidad in vitro a fungicidas de Botrytis cinerea Pers. Causante del Moho gris en el cultivo de Fragaria vesca I cv. Albion. (Tesis de grado. Ingeniero Agrónomo) // Escuela Superior Politécnica de Chimborazo. Riobamba – Ecuador. – 2017. http://dspace.espoch.edu.ec/handle/123456789/7649
Rupp S., Weber R.W.S., Rieger D., Detzel P., Hahn M. Spread of Botrytis cinerea strains with multiple fungicide resistance in German horticulture // Front. Microbiol. – 2017. – Vol. 7. – P.1-12. https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.02075.
Garfinkel, A. R., Lorenzini, M., Zapparoli, G., & Chastagner, G. A. Botrytis euroamericana, a new species from peony and grape in North America and Europe. – Mycologia. – Vol. 109(3). – P. 495–507. https://doi.org/10.1080/00275514.2017.1354169
Daugaard H. Effect of cultural methods on the occurrence of grey mould (Botrytis cinerea Pers.) in strawberries // Biological Agriculture and Horticulture. – 2000. – Vol. 18(1). – P. 77–83. https://doi.org/10.1080/01448765.2000.9754866